菲律宾在漫长历史时期内，其境内7000多个岛屿上虽有人居住，但并未形成国家形态，而最早到达菲律宾群岛的国家力量，是中国三国时期的东吴。
公元226(吴孙权黄武五年），东吴官员，宣化从事朱应、中郎康泰浮海巡抚东南亚，前后历时数十年，抵达过越南、柬埔寨和南洋群岛等地，也曾到过今天菲律宾境内的臣延、耽兰和杜薄。由于康泰回国后著有《吴时外国记》(俗称“扶南传”，扶南即柬埔寨)，这本书虽然早已亡佚，但裴松之注《三国志》时有所引述，《晋书》中也有提及。此次“出访”的目标是扶南，菲律宾各地仅是顺风路过，因此中国此时对菲律宾，也只能说是“到此一游”，去过而已。
隋唐时期，中国航海业空前发展，南方大港泉州十分繁荣，海船和航海设备也大为进步，已出现了中国-菲律宾之间的较固定海上贸易航线。由于风浪、潮流的关系，这条航线并非从福建沿海直接前往直线距离最近的吕宋岛(即今菲律宾群岛中的吕宋岛)，而是从泉州出发，先绕过海南岛，沿越南海岸线抵达越南南部的占城，然后继续沿海岸线南下，在马来半岛一带横渡南海，抵达加里曼丹岛的渤泥(文莱)，再从文莱北上，抵达今天菲律宾的苏禄群岛和棉兰老岛一带。
还应看到，唐代“海 上丝绸之路”十分繁荣，但菲律宾群岛却只是这条海上黄金航线的一个并不起眼分支。菲律宾列岛人烟稀少、经济落后，中国的大宗输出产品(丝绸、瓷器、茶叶)，当地市场容量有限，而当地出产的水果、香料、海产品等，其它南洋地方也不难买到。这条航线最重要的意义，是开辟了一条中国福建沿海居民迁徙菲律宾的通道，此后几百年间，吕宋等地逐渐聚集起不少华人，他们经商、务农，甚至成为海盗，在当地居住下来。
菲律宾第一个国家的第二代东王葬在山东
唐、宋、元三代，中国官方对菲律宾群岛的兴趣似乎并不大，一直到明初这种局面才开始改变。1405(明成祖永乐三)年，郑和第一次下西洋，在前往渤泥途中经停吕宋，在当地见到许多福建侨商，并应侨商请求，任命福建晋江籍华侨商人许柴佬为吕宋总督，此后直到1424年，吕宋岛的最高行政长官都是这位华侨商人。
从理论上讲，这17年是菲律宾和中国关系最直接、最密切的时期，因为此时吕宋最高行政长官是中国人，最高行政机构法理上直属中国明朝中央政府。但实际情况却远没这么夸张：郑和许下的不过是“纸上富贵”，既没有给兵，也没有派员，而许“总督”所能依靠的，不过是听命于己的一些商人、同乡和伙计，所能控制的不过是商埠周围一小块地盘，广大岛屿上绝大多数土地、人口他们既不能统治、管理，也无法征收赋税，甚至彼此间都未必知道对方的存在。1424年明成祖去世，明朝对外政策发生剧变，耗资巨大的“下西洋”因内部激烈争议暂停。
在此前后，吕宋以南，出现了菲律宾历史上第一个国家——苏禄苏丹国(在西班牙入侵菲律宾前，该国是当地社会经济比较发达的国家之一)。公元1409年郑和三下西洋时路过苏禄，在和乐与苏禄第二代东王巴哈剌会晤，并赠对方丰厚礼物。叭哈剌对中国富庶繁荣十分仰慕，与同信奉伊斯兰教的郑和也一见如故，请求同船到中国“朝觐观光”，但郑和当时领命出访印度、锡兰(斯里兰卡)，归期未卜，因此婉拒。叭哈剌在郑和走后向西王、峒王转述中国“盛况”，令二王啧啧称羡，三王决定共同设法赴华。
1417年，东王巴都葛叭哈剌、西王麻哈剌叱葛剌麻丁、峒王妻叭都葛巴剌卜及随员、家属等共340多人航海来到中国，当时明成祖正在北京为迁都做准备，苏禄三王抵达南京后又换船沿运河北上，于八月初一抵达北京朝觐，逗留27天，受到明成祖接见、赐封和隆重接待，进贡“金镂表文”和“珍珠、宝石、玳瑁诸物”，明成祖“赐印诰、袭衣、冠带及鞍马、仪仗器物，其从者亦赐冠带有差”，临行时再获接见，三王各获得“金镶玉带一条，黄金100两，白金2000两，罗锦文绮200匹，绢300匹，钞1万锭，钱3000贯，金绣蟒衣、麒麟衣各一袭”。
终明朝一世，外国国王亲自来访的寥寥无几，三王一齐来访的仅苏禄一例，因此所受的礼遇也是最郑重的，和南洋号称“最恭顺”的满剌加相同。
由于南北往返，舟车劳顿，加上寒流突袭，习惯热带气候的叭哈剌沿运河南下至山东德州，因病医治无效，于九月十三日与世长辞，遗命留葬中国。明成祖闻讯后派礼部郎中陈士启前往祭奠，以国王礼节将扒哈剌葬于德州，并赐谥号“恭定”。安葬扒哈剌后，西王、峒王一行辞别归国，而东王一家除长子都马含回国嗣位外，其余家属包括王妃葛本宁、叭都葛苏性，次子安都禄、三子温哈剌等10人留德州守墓。
苏禄苏丹国希望成为“中国固有领土”被乾隆拒绝
东、西、峒三王则得到明朝“册封”，属于东亚典型的“藩属关系”，但这种所谓“藩属国”并非真正的统治，而是一种特殊利益交换关系，即中国皇帝从“天无二日民无二主”传统理念，认为自己是天下万国宗主，其它国家都归自己“领导”，而弱小邻国一来畏惧中国实力，二来希望通过“朝贡”换得成倍的“赏赐”，获取利益，也乐得“嘴上服软”。不过，此后在明朝官书上，苏禄三王此后的“朝贡”记录寥寥无几。苏禄东王留下守墓“三年”的10名家属，仅叭都葛苏性一人在6年后归国，其余都留在德州，终明朝一世，他们的国籍都是苏禄，是明朝的“客人”。
17世纪，清朝取代明朝统治中国，此时江河日下的苏禄苏丹国，国王正是东王后裔，他们希望依靠中国，抵御西班牙人的步步蚕食。1726(清雍正四)年，苏禄苏丹遣使“朝贡”，重建了和中国的“藩属”关系;1731年，苏禄苏丹亲自“来朝”并拜谒了苏禄东王墓;1733年，苏丹应在德州守墓的东王后裔请求，上书雍正，希望给予这些人中国国籍，获得批准;1753(乾隆十八)年，苏禄“老苏丹”上《请奉纳版图表文》，请求将本国土地、丁户编入中国版图，这是因为苏禄被西班牙百般欺凌，强弱不敌，希望依托中国，寻求庇护。
但此时乾隆正奉行闭关锁国政策，对海岸线以外并无兴趣，甚至认为华侨都是“汉奸”，死不足惜，殖民者杀死华侨对中国有利，在这种思维定式下，他显然不会对纯属“外人”的苏禄请求有丝毫积极回应。苏禄希望成为“中国固有领土”的请求最终被婉言谢绝，但双方的“藩属”关系依旧维持。1851(清咸丰元)年，西班牙人占领苏禄古都和乐，苏禄和中国间的航路就此被切断，这一年也是中国太平天国金田起义的年份，此后中国自顾不暇，所谓“藩属”关系，也只剩下民国时清朝遗老所编“清史稿”中云山雾罩的几笔了。
1897年11月2日，吕宋成立了菲律宾第一共和国，1902年7月4日，美国吞并了菲律宾，次年宣布“摩洛兰”为“非法土地”，向原苏禄苏丹国领土大量移民。1946年7月4日，菲律宾第三共和国成立并维持至今，和“摩洛兰”的关系始终不睦，屡屡爆发战争和暴力冲突。1989年11月6日，“棉兰老穆 斯林自治区”成立，包括巴西兰、马京达瑙、南拉瑙、苏禄和塔威塔威五省;2012年4月26日，菲政府和摩洛伊斯兰解放阵线签署协议，宣布同意该组织在菲律宾南部组建“政治实体”，但具体细节尚未议定，目前南方这块苏禄故地局势仍十分微妙，至于“苏禄苏丹国”，理论上一直存在
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